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基于高通量基因表达数据库及生物信息学对 坐骨神经痛差异表达基因的分析研究
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R614

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云南省科技厅科学研究基金项目(编号:2023Y0966)


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    目的 基于高通量基因表达(GEO)数据库及生物信息学筛选坐骨神经痛相关差异表达基因(DEGs),分析其生物学功能, 为临床治疗坐骨神经痛提供参考。方法 通过GEO数据库获取坐骨神经痛基因芯片(GSE124272)数据集,经仙桃学术软件异质性分析获 取坐骨神经痛相关DEGs,对坐骨神经痛相关DEGs进行基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)的通路富集分析。借助 Cytoscape 软件实施蛋白质互作网络(PPI)分析获取关键基因,经转录因子调控网络专用数据库(TRRUST)确定关键基因的主要调节转录 因子及相应的调节关系。结果 415个坐骨神经痛相关DEGs经PPI分析共获取15个关键基因,经TRRUST确定共12个TF协同参与检 查点激酶1(CHEK1)、含杆状病毒IAP重复序列蛋白5(BIRC5)、细胞周期蛋白B2(CCNB2)、胸苷酸合成酶(TYMS)、细胞周期 蛋白B1(CCNB1)关键基因的调控。结论 CHEK1、BIRC5、CCNB2、TYMS、CCNB1 可作为坐骨神经痛的新治疗靶点和预防标志物。

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  • 在线发布日期: 2024-04-29
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